Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa10P31310 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa10P31310 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms