Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tacr1P30548 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms