Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc6a9P28571 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms