Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb9P28076 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms