Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmi1P25916 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmi1P25916 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 295.8 ms