Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PparaP23204 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PparaP23204 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PparaP23204 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PparaP23204 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PparaP23204 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PparaP23204 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PparaP23204 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PparaP23204 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PparaP23204 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PparaP23204 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PparaP23204 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PparaP23204 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PparaP23204 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PparaP23204 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PparaP23204 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PparaP23204 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PparaP23204 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PparaP23204 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PparaP23204 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PparaP23204 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PparaP23204 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PparaP23204 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PparaP23204 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PparaP23204 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PparaP23204 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PparaP23204 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PparaP23204 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PparaP23204 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PparaP23204 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PparaP23204 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PparaP23204 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PparaP23204 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PparaP23204 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PparaP23204 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PparaP23204 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PparaP23204 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PparaP23204 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PparaP23204 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PparaP23204 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PparaP23204 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PparaP23204 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PparaP23204 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PparaP23204 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PparaP23204 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PparaP23204 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PparaP23204 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PparaP23204 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PparaP23204 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PparaP23204 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PparaP23204 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PparaP23204 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PparaP23204 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PparaP23204 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PparaP23204 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PparaP23204 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PparaP23204 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PparaP23204 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PparaP23204 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PparaP23204 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms