Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefhP19246 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NefhP19246 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NefhP19246 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefhP19246 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NefhP19246 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefhP19246 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefhP19246 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefhP19246 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefhP19246 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefhP19246 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefhP19246 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefhP19246 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefhP19246 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefhP19246 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefhP19246 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefhP19246 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NefhP19246 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefhP19246 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefhP19246 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefhP19246 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefhP19246 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefhP19246 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefhP19246 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NefhP19246 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefhP19246 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefhP19246 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NefhP19246 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NefhP19246 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefhP19246 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefhP19246 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefhP19246 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefhP19246 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NefhP19246 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefhP19246 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefhP19246 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefhP19246 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefhP19246 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefhP19246 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefhP19246 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NefhP19246 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefhP19246 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NefhP19246 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefhP19246 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefhP19246 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefhP19246 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefhP19246 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefhP19246 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefhP19246 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefhP19246 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefhP19246 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NefhP19246 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefhP19246 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefhP19246 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefhP19246 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefhP19246 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefhP19246 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefhP19246 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NefhP19246 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefhP19246 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefhP19246 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefhP19246 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefhP19246 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefhP19246 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefhP19246 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefhP19246 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefhP19246 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefhP19246 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefhP19246 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefhP19246 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NefhP19246 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefhP19246 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefhP19246 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefhP19246 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefhP19246 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefhP19246 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefhP19246 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefhP19246 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefhP19246 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NefhP19246 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NefhP19246 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NefhP19246 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NefhP19246 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NefhP19246 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NefhP19246 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefhP19246 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefhP19246 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefhP19246 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms