Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpraP18052 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtpraP18052 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtpraP18052 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpraP18052 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpraP18052 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpraP18052 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpraP18052 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpraP18052 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpraP18052 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpraP18052 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtpraP18052 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpraP18052 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpraP18052 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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