Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim30aP15533 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30aP15533 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms