Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HPGDP15428 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HPGDP15428 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPGDP15428 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPGDP15428 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPGDP15428 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPGDP15428 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPGDP15428 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPGDP15428 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HPGDP15428 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPGDP15428 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPGDP15428 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPGDP15428 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPGDP15428 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPGDP15428 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPGDP15428 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPGDP15428 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPGDP15428 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPGDP15428 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
HPGDP15428 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HPGDP15428 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPGDP15428 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPGDP15428 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HPGDP15428 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HPGDP15428 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HPGDP15428 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPGDP15428 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HPGDP15428 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPGDP15428 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPGDP15428 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPGDP15428 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPGDP15428 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPGDP15428 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPGDP15428 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPGDP15428 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HPGDP15428 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPGDP15428 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPGDP15428 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPGDP15428 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPGDP15428 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HPGDP15428 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HPGDP15428 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HPGDP15428 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HPGDP15428 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HPGDP15428 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms