Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrm1P12657 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chrm1P12657 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrm1P12657 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrm1P12657 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrm1P12657 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrm1P12657 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrm1P12657 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chrm1P12657 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrm1P12657 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrm1P12657 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrm1P12657 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrm1P12657 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrm1P12657 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chrm1P12657 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrm1P12657 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrm1P12657 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrm1P12657 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrm1P12657 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrm1P12657 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrm1P12657 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrm1P12657 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chrm1P12657 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrm1P12657 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrm1P12657 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrm1P12657 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms