Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BMP3P12645 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BMP3P12645 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BMP3P12645 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BMP3P12645 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BMP3P12645 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BMP3P12645 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BMP3P12645 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BMP3P12645 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BMP3P12645 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BMP3P12645 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BMP3P12645 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BMP3P12645 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BMP3P12645 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BMP3P12645 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BMP3P12645 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BMP3P12645 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BMP3P12645 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BMP3P12645 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BMP3P12645 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BMP3P12645 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BMP3P12645 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
BMP3P12645 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BMP3P12645 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BMP3P12645 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BMP3P12645 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BMP3P12645 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BMP3P12645 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BMP3P12645 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BMP3P12645 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BMP3P12645 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BMP3P12645 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BMP3P12645 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BMP3P12645 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BMP3P12645 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BMP3P12645 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BMP3P12645 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BMP3P12645 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BMP3P12645 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BMP3P12645 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BMP3P12645 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BMP3P12645 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BMP3P12645 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BMP3P12645 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BMP3P12645 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BMP3P12645 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BMP3P12645 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BMP3P12645 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BMP3P12645 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BMP3P12645 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BMP3P12645 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BMP3P12645 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BMP3P12645 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BMP3P12645 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BMP3P12645 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BMP3P12645 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BMP3P12645 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BMP3P12645 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BMP3P12645 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BMP3P12645 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BMP3P12645 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BMP3P12645 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BMP3P12645 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BMP3P12645 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BMP3P12645 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BMP3P12645 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BMP3P12645 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BMP3P12645 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BMP3P12645 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BMP3P12645 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BMP3P12645 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BMP3P12645 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BMP3P12645 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms