Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FlgP11088 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FlgP11088 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FlgP11088 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FlgP11088 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FlgP11088 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FlgP11088 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FlgP11088 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FlgP11088 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FlgP11088 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FlgP11088 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FlgP11088 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FlgP11088 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FlgP11088 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FlgP11088 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FlgP11088 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FlgP11088 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FlgP11088 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FlgP11088 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FlgP11088 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FlgP11088 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FlgP11088 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FlgP11088 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FlgP11088 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FlgP11088 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FlgP11088 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FlgP11088 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FlgP11088 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FlgP11088 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FlgP11088 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FlgP11088 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FlgP11088 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FlgP11088 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FlgP11088 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FlgP11088 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FlgP11088 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FlgP11088 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FlgP11088 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FlgP11088 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FlgP11088 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FlgP11088 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FlgP11088 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FlgP11088 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FlgP11088 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FlgP11088 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FlgP11088 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FlgP11088 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FlgP11088 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FlgP11088 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FlgP11088 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FlgP11088 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FlgP11088 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FlgP11088 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FlgP11088 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FlgP11088 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FlgP11088 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FlgP11088 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FlgP11088 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FlgP11088 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FlgP11088 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FlgP11088 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FlgP11088 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FlgP11088 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FlgP11088 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FlgP11088 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FlgP11088 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FlgP11088 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FlgP11088 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FlgP11088 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FlgP11088 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FlgP11088 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FlgP11088 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FlgP11088 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FlgP11088 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FlgP11088 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FlgP11088 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms