Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM10L2BP0DMW5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms