Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF888P0CJ79 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms