Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00271P0C7V0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms