Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TNP1P09430 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
TNP1P09430 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TNP1P09430 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TNP1P09430 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TNP1P09430 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TNP1P09430 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms