Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP3P08254 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP3P08254 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP3P08254 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP3P08254 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP3P08254 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP3P08254 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP3P08254 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP3P08254 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP3P08254 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP3P08254 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP3P08254 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP3P08254 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP3P08254 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP3P08254 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP3P08254 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP3P08254 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP3P08254 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP3P08254 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP3P08254 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP3P08254 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP3P08254 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP3P08254 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP3P08254 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP3P08254 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP3P08254 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP3P08254 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP3P08254 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP3P08254 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP3P08254 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP3P08254 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP3P08254 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP3P08254 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP3P08254 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP3P08254 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP3P08254 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP3P08254 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP3P08254 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP3P08254 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP3P08254 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP3P08254 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP3P08254 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP3P08254 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP3P08254 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms