Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB1P08034 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB1P08034 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB1P08034 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB1P08034 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB1P08034 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB1P08034 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB1P08034 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB1P08034 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB1P08034 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB1P08034 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB1P08034 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB1P08034 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB1P08034 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB1P08034 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB1P08034 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB1P08034 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB1P08034 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB1P08034 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB1P08034 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB1P08034 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB1P08034 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB1P08034 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB1P08034 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB1P08034 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB1P08034 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB1P08034 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB1P08034 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB1P08034 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB1P08034 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB1P08034 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB1P08034 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB1P08034 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB1P08034 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB1P08034 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB1P08034 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB1P08034 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB1P08034 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB1P08034 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB1P08034 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB1P08034 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB1P08034 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB1P08034 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB1P08034 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB1P08034 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB1P08034 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB1P08034 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB1P08034 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB1P08034 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB1P08034 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB1P08034 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB1P08034 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB1P08034 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB1P08034 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB1P08034 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms