Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP1B1P05026 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP1B1P05026 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B1P05026 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B1P05026 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B1P05026 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B1P05026 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B1P05026 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B1P05026 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP1B1P05026 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms