Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC2P02585 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms