Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
P01798 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01798 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01798 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01798 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01798 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01798 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01798 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01798 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01798 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01798 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01798 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01798 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01798 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01798 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01798 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01798 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01798 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01798 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01798 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01798 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01798 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01798 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01798 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01798 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01798 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01798 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01798 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01798 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01798 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01798 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01798 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01798 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01798 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
P01798 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01798 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01798 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01798 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01798 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01798 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01798 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01798 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms