Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01679 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01679 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
P01679 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01679 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01679 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01679 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01679 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01679 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01679 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01679 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01679 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01679 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01679 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01679 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01679 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01679 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01679 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01679 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01679 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01679 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01679 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01679 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01679 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01679 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01679 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01679 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
P01679 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01679 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P01679 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P01679 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01679 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01679 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01679 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01679 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01679 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01679 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01679 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
P01679 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01679 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01679 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01679 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01679 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01679 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01679 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01679 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01679 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P01679 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01679 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01679 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01679 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01679 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01679 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P01679 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms