Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
P01650 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
P01650 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01650 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01650 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01650 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01650 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01650 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01650 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01650 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01650 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01650 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01650 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01650 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01650 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01650 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01650 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01650 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01650 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01650 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01650 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01650 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01650 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01650 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01650 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01650 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01650 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
P01650 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01650 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01650 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01650 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01650 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01650 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01650 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01650 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01650 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01650 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01650 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01650 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01650 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01650 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01650 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01650 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01650 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01650 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01650 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01650 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01650 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01650 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01650 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01650 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01650 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01650 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01650 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01650 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01650 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01650 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01650 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01650 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01650 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01650 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01650 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01650 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01650 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01650 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01650 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01650 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01650 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01650 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01650 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01650 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01650 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01650 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms