Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB6O95452 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB6O95452 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB6O95452 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB6O95452 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB6O95452 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB6O95452 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB6O95452 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB6O95452 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB6O95452 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB6O95452 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB6O95452 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB6O95452 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB6O95452 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB6O95452 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB6O95452 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB6O95452 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB6O95452 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB6O95452 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB6O95452 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB6O95452 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB6O95452 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB6O95452 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB6O95452 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 863.7 ms