Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx8O88983 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx8O88983 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stx8O88983 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx8O88983 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx8O88983 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx8O88983 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx8O88983 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx8O88983 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx8O88983 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx8O88983 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx8O88983 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms