Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSO75390 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSO75390 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSO75390 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSO75390 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSO75390 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSO75390 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSO75390 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSO75390 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSO75390 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSO75390 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSO75390 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSO75390 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSO75390 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSO75390 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSO75390 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSO75390 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSO75390 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSO75390 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSO75390 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSO75390 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSO75390 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSO75390 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSO75390 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSO75390 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSO75390 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSO75390 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSO75390 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSO75390 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSO75390 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSO75390 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSO75390 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSO75390 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSO75390 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSO75390 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSO75390 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSO75390 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSO75390 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSO75390 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSO75390 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSO75390 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSO75390 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSO75390 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSO75390 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSO75390 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSO75390 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSO75390 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSO75390 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSO75390 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSO75390 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSO75390 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSO75390 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSO75390 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSO75390 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSO75390 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSO75390 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSO75390 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSO75390 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSO75390 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSO75390 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSO75390 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSO75390 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSO75390 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSO75390 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSO75390 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSO75390 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSO75390 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms