Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNSO60931 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNSO60931 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNSO60931 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNSO60931 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNSO60931 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNSO60931 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNSO60931 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNSO60931 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNSO60931 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNSO60931 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNSO60931 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNSO60931 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNSO60931 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNSO60931 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNSO60931 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNSO60931 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNSO60931 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNSO60931 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNSO60931 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNSO60931 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNSO60931 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNSO60931 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNSO60931 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNSO60931 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNSO60931 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNSO60931 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNSO60931 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNSO60931 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNSO60931 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNSO60931 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNSO60931 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNSO60931 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNSO60931 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNSO60931 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNSO60931 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNSO60931 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNSO60931 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNSO60931 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNSO60931 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNSO60931 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNSO60931 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNSO60931 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNSO60931 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNSO60931 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNSO60931 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNSO60931 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNSO60931 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNSO60931 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNSO60931 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNSO60931 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNSO60931 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNSO60931 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTNSO60931 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNSO60931 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNSO60931 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNSO60931 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNSO60931 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNSO60931 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNSO60931 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNSO60931 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNSO60931 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNSO60931 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNSO60931 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNSO60931 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms