Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dsg2O55111 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms