Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f6O54917 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f6O54917 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f6O54917 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f6O54917 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f6O54917 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2f6O54917 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms