Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITM2AO43736 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms