Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf5O35445 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms