Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms