Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms