Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarb2O35114 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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