Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CckarO08786 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CckarO08786 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CckarO08786 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CckarO08786 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CckarO08786 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CckarO08786 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CckarO08786 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CckarO08786 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CckarO08786 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CckarO08786 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CckarO08786 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CckarO08786 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CckarO08786 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CckarO08786 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CckarO08786 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CckarO08786 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CckarO08786 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CckarO08786 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CckarO08786 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CckarO08786 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CckarO08786 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CckarO08786 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CckarO08786 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CckarO08786 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CckarO08786 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CckarO08786 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CckarO08786 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CckarO08786 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CckarO08786 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CckarO08786 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CckarO08786 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CckarO08786 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CckarO08786 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CckarO08786 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CckarO08786 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckarO08786 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CckarO08786 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckarO08786 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckarO08786 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckarO08786 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckarO08786 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CckarO08786 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CckarO08786 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckarO08786 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckarO08786 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckarO08786 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CckarO08786 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CckarO08786 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CckarO08786 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms