Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Barx2O08686 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Barx2O08686 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Barx2O08686 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx2O08686 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx2O08686 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Barx2O08686 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Barx2O08686 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Barx2O08686 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Barx2O08686 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Barx2O08686 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms