Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLIM4O00461 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLIM4O00461 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
GOLIM4O00461 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLIM4O00461 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLIM4O00461 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLIM4O00461 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLIM4O00461 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLIM4O00461 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GOLIM4O00461 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms