Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ccdc180J3QNE4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Ccdc180J3QNE4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ccdc180J3QNE4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms