Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20825J3QM67 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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