Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930544D05RikJ3QK56 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930544D05RikJ3QK56 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930544D05RikJ3QK56 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms