Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Gm20828J3KMI7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Gm20828J3KMI7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Gm20828J3KMI7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Gm20828J3KMI7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20828J3KMI7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Gm20828J3KMI7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Gm20828J3KMI7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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