Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0S8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
H7C0S8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0S8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0S8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0S8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0S8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0S8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0S8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0S8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0S8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0S8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0S8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0S8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0S8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0S8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0S8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0S8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0S8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0S8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C0S8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0S8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0S8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0S8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0S8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0S8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0S8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0S8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0S8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C0S8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0S8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0S8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0S8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0S8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0S8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0S8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0S8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C0S8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H7C0S8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H7C0S8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0S8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0S8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0S8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0S8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0S8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C0S8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0S8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0S8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0S8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0S8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0S8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0S8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0S8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0S8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0S8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C0S8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C0S8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C0S8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms