Protein–RNA interactions for Protein: H3BJD6

Ppp1r9a, Protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 9A, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r9aH3BJD6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp1r9aH3BJD6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r9aH3BJD6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp1r9aH3BJD6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r9aH3BJD6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r9aH3BJD6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.7 ms