Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmigd3G3X8R9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmigd3G3X8R9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms