Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf212F6TQD1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf212F6TQD1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms