Protein–RNA interactions for Protein: E9QAA8

Gm4841, Interferon-gamma-inducible GTPase Ifgga3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4841E9QAA8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4841E9QAA8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4841E9QAA8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4841E9QAA8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4841E9QAA8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm4841E9QAA8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm4841E9QAA8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4841E9QAA8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154 ms