Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc146E9Q9F7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc146E9Q9F7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms