Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm20425E9Q035 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20425E9Q035 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms