Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AU019823E9PUQ3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU019823E9PUQ3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AU019823E9PUQ3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms